Fitocenološke in floristične raziskave s poudarkom na gozdni, traviščni in subalpinsko-alpinski vegetaciji, predvsem v zahodni Sloveniji, v Julijskih Alpah in v severnem delu Dinarskega gorstva .

• Phytosociology and ecology of Rhamnus fallax in the Southeastern Alps and in the northern part of the Dinaric Alps. Igor Dakskobler, Wilfried Robert Franz, Andrej Rozman, 2013
• Forest and scrub communities with green alder (Alnus viridis) in Slovenia. Igor Dakskobler, Andrej Rozman, Andrej Seliškar, 2013
• Phytosociological analysis of communities with Adiantum capillus-veneris in the foothills of the Julian Alps (Western Slovenia). Igor Dakskobler, Andrej Martinčič, Daniel Rojšek 2014
• Phytosociological description of Ostrya carpinifolia and Fraxinus ornus communities in the Julijan Alps and in the northern part of the Dinaric Alps (NW and W Slovenia, NE Italy). Igor Dakskobler, 2015
• Pedicularis julica E. Mayer × Pedicularis rostratocapitata Crantz = Pedicularis × mayeri nothosp. nov., a new spontaneous hybrid in the genus Pedicularis L. Igor Dakskobler, Branko Vreš, 2016
• Phytosociological analysis of alpine swards and heathlands (pioneer patches) on ridges and peaks in the Julian Alps (NW Slovenia). Igor Dakskobler, Boštjan Surina,  2017
• Phytosociological analysis of montane-subalpine dwarf willow shrub communities in the Julian Alps and on the Trnovski gozd plateau (NW and W Slovenia). Igor Dakskobler, Boštjan Surina, 2017
• A new endemic plant community with Schoenus nigricans in the Southeastern Alps and northern Dinaric Alps. Igor Dakskobler, Andrej Martinčič, 2018
• Phytosociological analysis of European larch forests in the Southeastern Alps. Igor Dakskobler, Andrej Seliškar, Andrej Rozman,  2018

• Filogenija pajkov iz družine Nephilidae kot test antagonistične koevolucije spolov (01. september 2005 - 31. avgust 2007)
• Pregled živalskih in rastlinskih vrst, njihovih habitatov ter kartiranje habitatnih tipov ... na območju spodnje Save oziroma na vplivnem območju predvidenih HE Brežice in HE Mokrice (aplikativni projekt • 01. januar 2008 - 31. december 2009)
• Pregled živalskih in rastlinskih vrst, njihovih habitatov ter kartiranje habitatnih tipov ... na območju srednje Save (od HE Medvode do HE Vrhovo) (aplikativni projekt • 17. september 2009 - 30. oktober 2010)
• Kartiranje negozdnih habitatov Slovenije: Reka, Marindol, Volčeke, Kras, Mirna (aplikativni projekt • 11. november 2011 - 11. november 2011)
• Popisi začetnega stanja habitatnih tipov in ciljne vrste Loeslejeve grezovke (Liparis loeselli) ... na projektnih pilotnih območjih Zelenci, Planik, Vrhe... (Wetman 2011 - 2015, LIFE+NARAVA, LIFE09 NAT/SI/000374) (aplikativni raziskovalni projekt • 25. maj 2011 - 31. januar 2013)
• Naravni sestoji macesna v Sloveniji (ciljni raziskovalni program • 01. september 2008 - 30. september 2010)
• Gradienti in biodiverziteta: flora, favna in vegetacija (01. januar 2009 - 31. december 2012)